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北京大学第六医院门诊设有普通门诊、专家门诊、特需门诊、中西医结合门诊、神经内科门诊、多专家会诊以满足不同层次、不同问题患者的就诊需求;还设有进食障碍、成瘾行为、睡眠障碍、记忆障碍、行为分析治 疗、精神疾病康复咨询、心理、老年儿童等相关专业门诊，以满足就诊者对专科或特殊方向的咨询和治 疗需求。
北京大学第六医院是国家精神心理疾病临床医学研究中心，拥有国家卫健委唯 一的精神卫生学重点实验室，为教育部批准的精神病与精神卫生学国家重点学科。北京大学精神病学/心理学进入全球基本科学指标数据库(ESI)前1%，成为国际高 水平学科之一。
北大六院于2003年开始建立无抽搐电休克室，经过了十多年的发展，已经成为我院的重点科室之一，迄今为止，已经安全完成5万人次患者的，取得很好的效果。我院拥有一支具有丰富临床经验的MECT团队，包括：科主任1名，副主任医师1名，主治医师2名，麻醉科医师2名，主管护师2名，护师1名，护士1名。我院拥有世界一 流的仪器设备。
在临床精神病学领域，着重于以各类主要精神障碍为中心的临床与应用研究、精神临床研究、心理治 疗理论与实践研究、精神行为与神经认知评估工具的开发与应用研究等;主要开展精神分裂症、阿尔茨海默病及轻度认知障碍、老年期抑郁症、双相情感障碍、重性抑郁障碍等常见精神障碍的临床与应用基础研究，积极探索构建主要精神障碍多中心临床研究平台的工作机制，创建了较稳固的全国多中心协同研究网络;在相关疾病的神经生物学机制、早期诊断生物标记物、临床评估与早期干预等领域取得了重要进展。